Cùng với việc mã hóa end-to-end nội dung tin nhắn thì sắp tới WhatsApp cũng sẽ mã hóa tương tự cho các bản backup mà người dùng lưu trên iCloud và Google Drive. WhatsApp nói người dùng sẽ xài được tính năng này trong vài tuần nữa.
Các bản backup tin nhắn của WhatsApp sẽ được mã hóa 64-bit kèm theo key/mật khẩu. Bạn có thể lưu mật khẩu này ở ngoài hoặc trong các app quản lý password. Ngoài ra, khi tiến hành backup mới thì các bản backup cũ cũng sẽ tự động được xóa đi.